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概要

エピゲノムシーケンスは、遺伝子の機能や発現制御に深く関わる「エピジェネティクス情報」を網羅的に解析するサービスです。

ゲノム情報が生物の「設計図」であるならば、エピゲノム情報はそれがいつ、どのように使われるかを決定する「指令書」にあたります。

弊社では、次世代シーケンサー（NGS）を用いることで、ゲノム上のどの位置に化学修飾が起きているかを高精度に特定し、複雑な生命現象の解明をサポートいたします。

対応機種

NovaSeq X Plus (Illumina社)

対応ライブラリ調製キット

▪  Accel-NGS Methyl-Seq DNA Library
gDNAをお預かりしてEZ DNA Methylation kitを使用しバイサルファイト処理、 その後ライブラリ調製を実施します。

▪  SureSelect Human Methyl-Seq
▪  SureSelect Mouse Methyl-Seq
メチル化領域をターゲットとしてキャプチャし、Bisulfite変換を行った後、増幅してライブラリ調製を実施します。

その他記載にないキットをご希望の場合はこちらからご相談ください。

解析フローと納期

サンプル到着からRaw data納品を平均1～1.5か月で実施いたします。
※特殊案件でなく、機器トラブルなどが無い場合
※ライブラリQCについては、QC後問題がなければ特にご連絡はいたしません。

各ステップごとのサンプル状態に合わせて依頼内容をご選択いただけます。
※ ④のみの場合は弊社でシーケンスしたもののみの取り扱いとなります。
※ ③～をご希望のお客様はRun onlyでのご案内となります。
  詳細はこちら

サンプルQC基準値

データ解析例

▪  Mappping
取得したシーケンスデータが、ゲノム上のどの位置に対応する配列かを参照配列（リファレンス配列）と照合します。

▪  Methylation Level
バイサルファイトシーケンスで得られたリードを用いて、メチル化塩基の検出を行い、メチル化率を算出します。

▪  Differential methylation region
サンプルの個体間や群間で異なるメチル化を検出しています。 ペアでの解析となり、2サンプルから対応可能です。

▪  その他
記載にない解析をご希望の場合はこちらからご相談ください。

プラン例

プラン例1）
バイサルファイトシーケンス、Methylation Level解析希望の場合

機種 NovaSeq X Plus

ライブラリ調製 Accel Methyl-Seq DNA Library Kit

データ量 150Gb/sample

データ解析 Methylation Level

納品形態 HDD納品*

※本プランのようにデータ量が多い場合は、HDD納品が必須となります。詳しくはお問い合わせください。