微生物同定用rRNAシーケンス
概要
菌種を識別するために広く用いられている16S/ITS/28(26)S rRNAの配列を解析するため、DNA 抽出、PCR、シーケンス、Assembly、BLASTまでの包括的なサービスを国内最安で提供いたします。
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微生物同定用rRNAシーケンス 最新版フライヤー
特徴
- 菌株到着後、1~5営業日で結果報告 *1
- バクテリア、カビ、酵母が対象
- バクテリア16Sの場合、27F-1492Rで増幅したPCR産物をテンプレートに518Fと800Rでシーケンスし、1,300bp以上の配列データを保証します。
*1 一度のご注文で20 菌株以上をお送りいただく場合、5営業日よりお時間を頂戴する場合がございます。事前にご相談いただけますと幸いです。
弊社が提供する系統樹はあくまでも簡易的なものです。論文投稿に使用できるものではございません。予めご了承ください。
価格
1菌株あたり、8,800円(税込)
- 一度にお送りいただける菌株数に応じて価格を調整いたします。お気軽にお問い合わせください。
- 送料無料です。
- 菌株は着払でお送りください。
-
良好なシーケンス結果が得られなかった場合には、追加費用なしで再抽出~再シーケンスをいたします。
複数回のgDNA抽出~シーケンスを実施してDNAの増幅またはシーケンス結果の改善が見られない場合は、その時点で解析を終了する場合がございます。 -
菌株の状態によってはシーケンス結果を得られない場合もございます。
その場合でも解析費用は全額請求となりますので、あらかじめご了承ください。
解析結果
解析が終了次第、以下のデータをダウンロードしていただくことができます。
・シーケンス結果(Raw data)
ab1, txt, pdf, phd, scf ファイルの5種類がございます。
・Contig配列
シーケンス結果から作成されたContigの情報です。
・Blast解析結果
Contig配列をクエリにしてBlast N解析をした結果です。
・Report
菌株ごとの解析結果について、まとめたレポートです。
データのダウンロードは結果通知メールのリンクまたはマイページお願いします。
*結果は1か月以内にダウンロードをお願いいたします。納品から1か月経過しますとデータを削除いたします。
*サンプルの保管期間は納品日より10日間です。保管期間を経過したサンプルは弊社にて滅菌処理いたします。
*当サービスでは弊社スタッフによる菌種同定は致しません。解析結果をご確認の上、お客様ご自身にてご判断ください。
菌株の準備
- 菌株は純粋培養されたシャーレまたはグリセロールストックでお送りください。
*病原性を有する可能性のある菌株の場合、抽出はお受けできません。抽出済DNAの状態でお送りください。
- コロニーが目視で確認できる状態でお送りください。
- パラフィルムなどで封をお願いします。
- 冷蔵便でお送りください。
- 遠心時にペレットが確認できる程度の菌量を、1mLほどお送りください。
- 冷凍便でお送りください。
プライマーセット
- 下図に示したプライマーセットのうち、ご希望のセットで解析いたします。また1セットだけでなく、2セットでの解析も可能です(別途料金が発生いたします)。
- 解析終了後、別のプライマーセットでの追加解析をご希望の場合はウェブオーダーより新規ご注文登録していただき、付記事項欄に「【初回ご注文番号】の追加解析分」とご記入ください。
- 下図に無い、カスタムプライマーでの解析をご希望の場合はお問い合わせフォームからご相談ください。