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NovaSeq6000

概  要

  • 幅広いアプリケーションに対応した最新大規模シーケンサー
  • NovaSeqシステムは、複数の選択肢から最適なフローセルを選択することで、全ゲノムシーケンスからトランスクリプトームまで、幅広いアプリケーションに対応したイルミナ社の最新大規模シーケンサーです。大規模シーケンサーHiSeqXと比較して、時間あたり3倍のデータ量を達成しました。一回のシーケンス解析により大量のデータを取得できるため、 短期間かつ安価に、 幅広いアプリケーションを提供できます。

  • 高スループットデータを実現する高密度整列化フローセル
  • さらに超高密度なクラスター形成を可能にする改良された整列化フローセルおよび高性能なカメラにより、フローセルあたりのデータ量が飛躍的に向上しました。

  • 高スループットデータに貢献する専用ケミストリー
  • 世界で最も広く使われている実績のあるSequencing By Synthesis (SBS)ケミストリーを採用しており、 業界最高品質のデータを提供します。 超高密度整列化フローセルを活用するため、NovaSeqシステム専用のSBSケミストリーを用いて解析を行います。

  • 少数サンプルの解析を可能にするマクロジェン・ジャパン相乗りプラン
  • 幅広いお客様に弊社次世代シーケンス解析をご利用いただくため、複数のお客様のサンプルをまとめてシーケンス解析を行う、相乗りプランを提供致しております。相乗りプランにより、少数サンプルでも無駄なく解析をご利用頂けます。また、出力データ量は1Gb単位でご指定頂けるため、研究目的に沿ったデータ量を提供致します。複数のお客様のサンプルをまとめてシーケンス解析することで、ランニングコストが抑えられるため、安価にサービスを提供致します。


対応可能なアプリケーション

  • 全ゲノムリシーケンス解析*1
  • NovaSeq6000を用いた次世代シーケンス解析により、全ゲノム配列が同定されていない生物種の全ゲノム配列を決定します。全ゲノム配列が解析されている生物種においては、取得した全ゲノム配列データを、データベース等より取得した全ゲノムリファレンス配列と比較します。

    お預かりするサンプル
     ・ゲノムDNA
     ・プーリングしたライブラリ*2

    データ解析*3
     ・アセンブリ
     ・遺伝子予測/アノテーション
     ・全ゲノムリファレンス配列へのマッピング
     ・一塩基多型 (SNVs/SNPs)
     ・塩基挿入/欠失 (InDel)
     ・コピー数多型 (CNVs)
     ・構造解析 (SVs)

  • トランスクリプトーム解析
  • NovaSeq6000を用いた次世代シーケンス解析により、mRNA、ノンコーディングRNA、スモールRNA等の配列を解読し、発現量を比較します。

    お預かりするサンプル
     ・トータルRNA
     ・精製したmRNA*2
     ・精製したスモール RNA*2

    データ解析*3
     ・リファレンス全ゲノム配列へのマッピング
     ・転写産物発現量比較 (DEGs)
     ・アセンブリ
     ・遺伝子予測/アノテーション

  • エキソーム解析
  • NovaSeq6000を用いた次世代シーケンス解析により、ヒト・マウスのエキソン領域の塩基配列を解読し、データベース等より取得した全ゲノムリファレンス配列と比較します。

    お預かりするサンプル
     ・ゲノムDNA

    データ解析*3
     ・全ゲノムリファレンス配列へのマッピング
     ・一塩基多型 (SNVs/SNPs)
     ・塩基挿入/欠失 (InDel)
     ・コピー数多型 (CNVs)
     ・構造解析 (SVs)

    *1 シーケンス解析の一例です。記載のない解析もご相談ください。
    *2 1レーンを買収頂く場合のみ、お預かりできます。相乗りは受け付けておりません。
    *3 データ解析の一例です。記載のない解析もご相談ください。


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