top_email.jpg 一般シーケンス / premix / その他 NGS / BI



DNAの品質

  • コンタミがなく,分解していない2本鎖DNA
  • ゲルまたはカラムで精製したDNA
  • A260/280の割合が1.8-2.0

RNAの品質

  • RIN(RNA Integrity Number)値が7以上
  • 28S rRNAバンドの厚さが18S rRNAバンドの約2倍

サンプル量の測定方法(弊社推奨)

  • DNAサンプルは、Victor 3 fluorometryによるPicoGreen法
  • RNAサンプルは、2100 BioanalyzerまたはTapeStationを使用


GS FLX

Library Type Sample Type conc.(ng/ul) vol.(ul)* total amount(ug)
Shotgun library
(Rapid Shotgun)
High Molecular Weight
DNA ( >1.5kb)
>50 >20 1
PCR product , Low molecular
weight
>10 >20 >0.2
Mate Pair library 3kb insert >100 >50 >5
8kb insert >100 >150 >15
20kb insert >100 >300 >30
Rapid cDNA library purified mRNA >11 >19 >0.2
Total RNA >250 >200 >50

* minimum concentration should maintain constantly regardless of volume condition.



HiSeq / MiSeq

Library Type Sample Type conc.(ng/ul) vol.(ul)* total amount(ug)
Shotgun (TruSeq) DNA >20 >50 >1
Mate Pair Library (up to 5kb) DNA >100 >100 >10
mRNA Library total RNA >20 >50 >4
mRNA >10 >10 >0.1
small RNA Library total RNA - - >3
ChIP seq library* - - - >10ng
Nextera library DNA 2.5 >20 >50ng
Lucigen library DNA 10~20ug / ul >10 100~200

* 200~300bp size sonicated samples are desired, and Control DNA must be provided. If you don’t want sequence the control DNA, please contact in advance.



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