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Technical Performance


Applications GS-FLX GS-FLX+ HiSeq2000 MiSeq HiSeq X Ten Pac Bio RS II
Performance Read number
(million)
1.3 1.3 6000 12 12,000 ~0.05/cell
Read length (bp) ~400 > 500 1X50~2x100 1X36~2x150 2X150 ~30,000
Throughput per plate 360~560Mb 500~800Mb 75GB~300GB 440Mb~4.6Gb 800GB~900GB ~375 Mb/cell
Physical run type 1/2,1/4,1/8 1/2,1/4,1/8 8 lanes 1 lane 8 lanes 8 SMRT cells
Technology Running time
(Instrument +
Primary analysis1)
10 hours+1day 20 hours+2 days (up to2)
12day+3days
(up to3) 27 hours
+2 hours
3 days
+ 20 hours
~3 hours/cell
Library Type multiplexing up to 12 MIDs4 up to 12 MIDs up to 348 IDX up to 348 IDX up to 2 IDX
Shotgun library
Mate Pair library 3kb,8kb,20kb up to 10kb
Amplicon library

1. Primary analysis means basic analysis only (raw data, base calling and assembly)
2. Paired read/run (2x100bp) base
3. Paired read/run (2x150bp) base
4. MIDs is Multiplex Identifiers defined by Roche Technical Bulletin (TCB No. 005-2009)


Recommended NGS platform for specified application
Available NGS platform for specified application



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